تبنت وحدة التطوير والجودة بكلية العلوم الطبية التطبيقية ستة أهداف عامة وهي:

1. نظام داخلي شامل وفاعل لضمان الجودة والتحسين المستمر بالكلية.
2. إعداد وتهيئة الكلية للحصول على الإعتماد الأكاديمي محليا وعالميا.
3. دمج ثقافة الجودة الشاملة والتحسين المستمر في العملية التعليمية والبحثية والإدارية.
4. تنمية قدرات منسوبي الكلية في مجال تطبيقات الجودة .
5. دعم وتشجيع الإبداع والتميز وتنمية روح المنافسة في الكلية.
6. زيادة فاعلية الكلية في التنمية المستدامة وخدمة المجتمع من خلال الأنشطة التعليمية والبحثية والإستشارية.